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卡博替尼可能与这些药物相互作用，包括处方药、非处方药、疫苗、维生素、中药等。这些药物与卡博替尼一起使用前，请咨询医生。
健康受试者给予强CYP3A4抑制剂酮康唑（400毫克/天，共27天），可增加本品单剂量暴露量（AUC0～inf）约38％，服用本品时，应避免同服强CYP3A4抑制药（如酮康唑、伊曲康唑、克拉霉素、阿扎那韦、茚地那韦、奈法唑酮、奈非那韦、利托那韦、沙奎那韦、泰利霉素、伏立康唑）。
健康受试者给予强CYP3A4诱导剂利福平（600毫克/天，共31天），可降低本品单剂量暴露量（AUC0～inf）约77％，应避免同服CYP3A4诱导剂（如地塞米松、苯妥英钠、卡马西平、利福平、利福布汀、利福喷汀、苯巴比妥、贯叶连翘制剂）。
在人肝微粒体酶系中，本品为CYP2C8非竞争性抑制剂、CYP2C9混合型抑制剂、CYP2C19及CYP3A4弱竞争性抑制剂。在培养的人肝细胞中，本品为CYP1A1mRNA诱导剂，但对CYP1A2、CYP2B6、CYP2C8、CYP2C9、CYP2C19或CYP3A4mRNA或其同工酶系无影响。