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那他霉素滴眼液是眼科用来治疗真菌性角膜炎和真菌性角膜溃疡最常用的药物之一，此外还有氟康唑滴眼液，也是比较常用的，那他霉素滴眼液抗真菌感染效果非常好，但是价格比较贵。
真菌性角膜炎和真菌性角膜溃疡，通常是继发于植物性眼外伤之后，例如不小心被树枝或树叶划伤眼睛，均有可能发生真菌感染。真菌性的角膜炎和角膜溃疡起病比较慢，主要表现为眼睛发红、眼睛异物感、怕光流泪、不愿意睁眼睛、视物模糊等，病情会逐的加重。普通的抗生素滴眼液效果并不好。
真菌性角膜炎治疗起来非常棘手，发现真菌感染之后，尽快用药，并且观察病情变化，必要时需通过手术治疗，如发生真菌性角膜溃疡穿孔的风险，就要考虑角膜移植手术。